拱形波纹屋面施工包劳务存在一些较为明显的缺点。这种方式可能会导致施工过程中劳务方自主性过强，管理协调难度加大，质量和进度难以得到有效保障。
施工质量较难保证。劳务方可能因追求效率而忽视质量标准。例如，在材料安装环节，若工人操作不熟练，可能导致屋面拼接不严密，影响防水性能。据行业通行做法，约有20% - 30%的此类施工项目，后期会出现不同程度的质量问题，如屋面渗水等。
施工进度较难控制。劳务队伍的组织协调可能存在问题，导致各工序衔接不顺畅。比如，在材料供应与安装的配合上，若出现供应延迟，可能使安装工作停滞。一般来说，此类施工项目进度延误的概率在15% - 25%左右。
成本容易超支。劳务方可能为节省成本而选用质量稍差的材料，或者在施工中偷工减料。而且，管理不善可能导致返工，进一步增加成本。据估算，采用施工包劳务方式，成本超支10% - 20%的情况并不少见。
安全风险较高。劳务人员安全意识参差不齐，缺乏系统培训。在高空作业时，如屋面安装，若未做好防护措施，极易发生坠落事故。相关统计显示，此类施工项目安全事故发生率比正规管理施工高出30% - 50%。
后续维护比较麻烦。由于施工质量和材料问题，后期出现故障时，责任界定困难。劳务方可能与发包方互相推诿，导致维修不及时，影响屋面正常使用。
